根据肿瘤细胞的形态不同，可分为不同的病理类型
(1)非浸润性癌，包括导管原位癌(导管内癌)和小叶原位癌，其中导管原位癌最多。非浸润性癌是乳腺癌的早期阶段，预后最好，治疗也最简单，疗效也最好，大多数患者可以治愈。
(2)非特殊型浸润性癌，包括浸润性导管癌和浸润性小叶癌。浸润性导管癌发源于泌乳的导管，是乳腺癌中最常见的病理类型，占全部病例的70%—80%。
(3)特殊型浸润性癌：包括典型髓样癌、粘液腺癌、小管癌、乳头状癌和乳头派杰病等多种类型。术后病理报告中还常常会描述肿瘤大小，但肿瘤大小并不代表恶性程度，小的肿瘤也可能生长很快，大的肿瘤也可能生长缓慢。
目前，雌激素受体/孕激素受体(ER/PR)的表达是临床判断是否对内分泌治疗有效的最重要的标志物。如果癌细胞上检测出ER和/或PR，即报告为ER/PR阳性，也可写成ER(+)/PR(+);反之则为ER/PR阴性，写成ER(-)/PR(-)。对于激素受体状态，各家医院的报告不一，更精确的做法是报告阳性细胞所占的比例，如ER〉75%(+)、PR25%～50%(+)等。
病理报告中，还有一个非常重要的生物学指标HER-2基因状况。HER-2也叫HER-2/neu，是一种能够帮助调控细胞生长、分裂和自身修复的基因，大约1/4的乳腺癌具有HER-2基因的多个拷贝。HER-2基因所产生的蛋白叫P185。具有多个HER-2基因拷贝或过度表达P185蛋白质的癌细胞生长较快，转移的危险也大，但针对HER-2基因的单克隆抗体治疗非常有效。HER-2的检测方法有两种，一种为免疫组织化学法(IHC);另一种为荧光原位杂交法(FISH)。IHC法用0、1+、2+和3+表示，FISH则用“阳性”和“阴性”表示。只有IHC3+或FISH阳性的患者才对HER-2单克隆抗体治疗效果好。